En raison du processus semiconducteur hautement reproductible, les intensités de fluorescence mesurées sur la plateforme CytoFLEX sont linéaires avec les paramètres de gain correspondants du détecteur. En raison de la linéarité de gain du semiconducteur, la matrice de compensation obtenue à un paramètre de gain peut être utilisée pour des expériences réalisées à différents paramètres de gain. Les éléments de la matrice de compensation obtenus à différents paramètres de gain peuvent être combinés pour former une matrice complète, la Bibliothèque de compensation.