L'une des principales applications de la biologie synthétique est la conception de nouvelles voies métaboliques dans les systèmes d'expression microbiens en vue d'obtenir des produits innovants, tels que des biocarburants et de nouveaux éléments chimiques. Ces bioprocédés modernes utilisent des matières premières renouvelables comme substrats et créent une nouvelle industrie durable, connue sous le nom de bioéconomie.

La technologie du BioLector peut être appliquée dans ce domaine afin d'étudier le comportement physiologique des insectes synthétiques. En modifiant les voies métaboliques, le comportement de croissance et l'acidification du micro-organisme peuvent également être affectés, ce qui doit être étudié en détail avant de concevoir un nouveau bioprocessus. La technologie des microbioréacteurs permet de traiter tous ces nouveaux microorganismes dans différentes conditions de culture ou de milieu de culture à haut débit, avec des paramètres de processus surveillés en ligne.

Les producteurs générés peuvent facilement être caractérisés et comparés par des taux de croissance spécifiques, des taux d'acidification, la consommation d'oxygène, ou par des taux de formation de produits. En outre, en utilisant des protéines fluorescentes (par exemple GFP) comme rapporteurs, le microbioréacteur BioLector XT est fréquemment utilisé pour la caractérisation de base de nouveaux promoteurs ou même de bibliothèques entières de promoteurs synthétiques.