La Génomique Sur Cellule Unique
Bibliothèques de séquençage de faibles volumes à partir de cellules uniques
Les systèmes Echo miniaturisent la préparation de bibliothèques pour l’analyse de génomes entiers et de transcriptomes à partir du matériel génétique de cellules uniques. Grâce à des transferts sans contact, précis et exacts, les systèmes Echo peuvent réduire l'amplification par déplacements multiples (MDA) et les réactions de séquençage d'ARN de 75 % ou plus. Les bibliothèques pour le séquençage de nouvelle génération (NGS) de l'ARN ou de l'ADN peuvent être réduites à 10 µL ou moins.
La génomique sur cellule unique est essentielle pour la compréhension des variations génétiques et épigénétiques qui se produisent tout au long de la vie d'un organisme. Par exemple, les programmes de recherche sur le cancer reposent sur la génomique par cellule unique pour surmonter les défis associés aux données provenant d'échantillons de tumeurs hétérogènes en étudiant les types cellulaires individuels au sein d'une population et d'événements cellulaires rares.
L’amplification de l'ADN à partir d'une cellule unique est par nature sensible à la contamination. L'ADN exogène provenant de cônes ou de buses utilisés pour le transfert d'échantillons ou de réactifs dans une réaction de PCR ne peut pas être éliminé, même avec des étapes d’irradiation UV avant le transfert. Le transfert sans contact des liquides, basé sur l'énergie acoustique de l'Echo, permet d’éviter tout contact avec un ADN, réduisant ainsi le risque de contamination de façon considérable. De plus, la précision et l’exactitude du transfert de nano-volumes éliminent la répétition des expériences, ce qui réduit davantage les coûts liés aux réactifs.
En associant la capacité de transfert acoustique de faibles volumes de l'automate de transferts de liquides Echo avec des kits de préparation de bibliothèques pour le séquençage de l'ADN ou de l'ARN, les chercheurs peuvent augmenter considérablement le nombre de bibliothèques générées avec chaque kit. En réduisant les volumes de transfert de 75 % ou plus et le pooling des bibliothèques pour le séquençage sans dilutions itératives, les systèmes Echo sont en mesure de miniaturiser et d’améliorer la qualité des bibliothèques préparées à partir de cellules isolées.
Réduire les volumes réactionnels et éliminer les risques de contamination croisée
La génomique sur cellule unique est essentielle pour la compréhension des variations génétiques et épigénétiques qui se produisent tout au long de la vie d'un organisme. Par exemple, les programmes de recherche sur le cancer reposent sur la génomique par cellule unique pour surmonter les défis associés aux données provenant d'échantillons de tumeurs hétérogènes en étudiant les types cellulaires individuels au sein d'une population et d'événements cellulaires rares.L’amplification de l'ADN à partir d'une cellule unique est par nature sensible à la contamination. L'ADN exogène provenant de cônes ou de buses utilisés pour le transfert d'échantillons ou de réactifs dans une réaction de PCR ne peut pas être éliminé, même avec des étapes d’irradiation UV avant le transfert. Le transfert sans contact des liquides, basé sur l'énergie acoustique de l'Echo, permet d’éviter tout contact avec un ADN, réduisant ainsi le risque de contamination de façon considérable. De plus, la précision et l’exactitude du transfert de nano-volumes éliminent la répétition des expériences, ce qui réduit davantage les coûts liés aux réactifs.
En associant la capacité de transfert acoustique de faibles volumes de l'automate de transferts de liquides Echo avec des kits de préparation de bibliothèques pour le séquençage de l'ADN ou de l'ARN, les chercheurs peuvent augmenter considérablement le nombre de bibliothèques générées avec chaque kit. En réduisant les volumes de transfert de 75 % ou plus et le pooling des bibliothèques pour le séquençage sans dilutions itératives, les systèmes Echo sont en mesure de miniaturiser et d’améliorer la qualité des bibliothèques préparées à partir de cellules isolées.
Avantages clés
- Réduction des coûts d'exploitation grâce à la miniaturisation efficace des dosages
- Élimination de la contamination croisée
- Amélioration de la qualité des données avec des volumes de dosage aussi faible que 250 nL
- Systèmes intégrés et logiciels adaptés aux analyses génomiques
